海洋工程学院建有船舶与海洋工程校级重点学科一个。学科承担着学校建设一流海洋特色学科和服务国家海洋强国战略的重要任务。为江苏省船舶与海洋工程行业、船舶检验、海事、交通运输和海洋资源开发等部门培养了大批高水平工程技术人员和管理人员。
目前船舶与海洋工程学科已拥有中地共建船舶先进制造中心、国家国际科技合作基地-中乌海洋智能装备工程研究中心、省海洋智能装备工程研究中心、省外国专家工作室、省海洋智能装备国际合作联合实验室、市海洋与船舶工程研发公共服务平台等省市级科研创新平台，并建有省内高校最大海洋工程技术研究中心，能够为本学科方向提供大型试验和检测手段。
学科支撑专业是船舶与海洋工程专业和海洋资源开发技术专业，船舶与海洋工程专业为国家一流专业、省一流专业和省品牌专业建设点。拥有士木水利专业-海洋工程领域专业硕士点。学科队伍现有教授3人，副教授7人，其中博士21名，省双创人才3名，省科技副总9名，市“521"人才6名，70%教师具有境外研修经历。
本学科围绕国家和区域重大海洋战略需求，重点在船舶与海洋结构物设计与建造、智能制造技术、无人船艇技术、海洋资源开发技术与装备等五个方向开展科学研究和技术应用，近三年，累计获批国家级项目6项，省部级项目9项，市厅级项目9项，累计完成科研经费1000余万元；累计获市级及以上科研奖项9项；授权专利30余件，转让4件；发表论文近百篇，其中SCI、El收录论文35篇。
